Nukleinsäurechemie

 

Mitarbeiter

Dr. habil. Rolf Bald (Leiter)

Özlem Kumas

 

 

Kurzbeschreibung des Projektes

Ein Schwerpunkt des Labors ist die präparative organische Synthese von seltenen und unnatürlichen Nukleosiden, Nukleotiden und deren Derivaten. Dabei handelt es sich einmal um modifizierte Nukleoside im heterocyclischen Teil:

Nukleoside mit zusätzlichen Substituenten,

Nukleoside mit funktionellen Gruppen in anderen Positionen,

Nukleoside mit anderen Verknüpfungsstellen des Zuckers,

Nukleoside mit fluoreszierenden Eigenschaften.

Daneben werden Nukleoside mit anderem oder verändertem Zuckerteil synthetisiert. Modifikationen der Phosphatgruppe des Oligonukleotids können als Phosphor-modifizierte geschützte Nukleosid-Phosphoramidite oder bei automatischen chemischen Synthesen im Oxidationsschritt des Zyklus eingefügt werden. Für Polymerasen werden modifizierte Substratanaloga oder Primer dargestellt.

Zweck dieser Produkte ist die Verwendung in der chemischen Synthese von Oligonukleotiden, die zur Untersuchung von Struktur und Funktion der RNA dienen bzw. die zur Stabilisierung der RNA gegenüber nukleolytischen Enzymen beitragen. Die Oligonukleotide werden innerhalb der AG Prof. Dr. V. A. Erdmann oder von Kooperationspartnern der AG weiter untersucht.

 

Wichtigste Publikationen

Nolte, A.; Klußmann, S.; Bald, R.; Erdmann, V.A.; Fürste, J.P. Mirror-design of L-oligonucleotide ligands binding to L-arginine. Nature Biotechnology, 14, 1116-1119 (1996)

Klußmann, S.; Nolte, A.; Bald, R.; Erdmann, V.A.; Fürste, J.P. Mirror-image RNA that binds D-adenosine. Nature Biotechnolgy, 14, 1112-1115 (1996)

Perbandt, M.; Nolte, A.; Lorenz, S.; Bald, R.; Betzel, C.; Erdmann, V.A. Crystal structure of domain E of Thermus flavus 5S rRNA: a helical RNA structure including a hairpin loop. FEBS Letters 429, 211-215 (1998)

Henderson, B.S.; Beuning, P.; Shi, J.-P.; Bald, R.; Fürste, J.-P.; Erdmann, V.A.; Musier-Forsyth, K.; Schimmel, P. Subtle Functional Interactions in the RNA Minor Groove at a Nonessential Base Pair. J. Am. Chem. Soc. 120, 9110-9111 (1998)

 

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Letzte Änderung: 29.1.2001