Kristallisation von ribosomaler 5S Ribonukleinsäuren (5S rRNA) und 5S rRNA-Proteinkomplexen für die Röntgenstrukturanalyse.

Projektleiter: Marco Vallazza, Tel.: +49 30 838 6414, email: vallazza@chemie.fu-berlin.de

Mitarbeiter: Andrea Senge

Die 5S rRNA ist ein essentieller Bestandteil des Ribosoms und ist mit ribosomalen Proteinen assoziiert. Die Bestimmung der dreidimensionalen Struktur dieser RNA würde nicht nur einen wesentlichen Beitrag zum derzeitigen Verständnis der ribosomalen Eiweißsynthese liefern, sondern auch unsere Kenntnisse über andere RNA-Strukturen und ihre Wechselwirkung mit Proteinen erweitern. Die 5S rRNA besteht aus ca 120 Nukleotiden, deren Anordnung als zweidimensionale Struktur bekannt ist. Bei unseren umfangreichen Kristallisationsexperimenten mit verschiedenen 5S rRNA Molekülen hat sich ergeben, daß die 5S rRNA aus bestimmten thermophilen Bakterien am besten zur Kristallisation geeignet sind. Da bisher die innere Ordnung der Kristalle noch nicht für eine Röntgenstrukturanalyse ausreichen, sollen bestimmte biochemische Veränderungen innerhalb der Moleküle die Struktur stabilisieren. Weitere Komponenten, die Kristallisationseigenschaften der 5S rRNA zu verbessern, werden die ribosomalen Bindungsproteine sein, welche mit der 5S rRNA einen stabilen Komplex bilden. Die Struktur einer chemisch synthetisierten Domäne der thermophilen 5S rRNA ist von uns bereits durch die erfolgreiche Kristallisation und Röntgenstrukturanalyse gelöst worden.

Marco Vallazza, vallazza@chemie.fu-berlin.de